Разлика помеѓу секвенционирање на цел геном и секвенционирање на пушка

Кои се секвенционирање на цел геном и секвенционирање на пушка?

Ова се методи што се користат за проценка и секвенци на ДНК на геномот на организмот во исто време.

Сличноста

Сличностите помеѓу секвенционирањето на целиот геном и секвенционирањето на пушка вклучуваат;

  • И двајцата се вклучени во секвенционирање на фрагменти од Деоксирибонуклеинска киселина
  • И двете техники вклучуваат геномска фрагментација
  • И двете техники користат дигитализација и се базирани на компјутер
  • И двете техники играат клучна улога во истражувачките студии и во молекуларната дијагностика

Секвенционирање на целиот геном

Секвенционирање на цел геном ака (WGS) е детална техника за истражување на целата геномска секвенца на деоксирибонуклеинска киселина на клетка во исто време.

Секвенционирањето на целиот геном стана достапно по објавувањето на Проектот за човечки геном, кој обезбеди референца за секвенците на човечкиот геном.

Редоследување на пушка

Редоследот на пушката вклучува непланирано разделување на деоксирибонуклеинска киселина што ги разложува секвенците на деоксирибонуклеинска киселина во многу мали фрагменти и потоа повторно ги собира (секвенцата) со откривање на регионите на преклопување.

Разлика помеѓу секвенционирање на целиот геном и пушка

Опис

Секвенционирање на целиот геном

Редоследот на целиот геном (WGS) е процес на уредување во еден чекор. Во оваа техника, прво се случува сечење на целиот геном (хаплоиден сет на хромозоми во микроорганизам). По ова, секој од овие мали кршливи парчиња се подложува на процес на уредување по случаен избор. Откако ќе заврши овој аранжман или секвенционирање, се случува анализата. Постои елиминација на преклопувачки процес на секвенционирање во времето на проценка на аранжманот/секвенците, а проценката не е нарачана техника. Оттука, собранието на секвенци е помалку успешен и ефикасен процес. Како и да е, процесот на секвенционирање на целиот геном е побрз и проценката на целиот геном (хаплоиден сет на хромозоми во микроорганизам) може да се случи во еден случај.

Редоследување на пушка

Секвенционирање на пушка е лабораториски метод за проценка на секвенцата на Деоксирибонуклеинска киселина на генетскиот материјал на организмот (геном). Техниката е вклучена во разложувањето на генетскиот материјал на организмот во мали фрагменти од Деоксирибонуклеинска киселина кои претставуваат индивидуално секвенционирање.

Користи

Секвенционирање на целиот геном

  • Новородени и детски болести - Одзема структурни варијанти и скенира егзонични области кои не се соодветно заробени.
  • Испитувања на лекови и фармакогеномика-WGS нуди корисен механизам за клинички испитувања, што помага при класификација на поединци (пациенти) врз основа на нивниот одговор на лекот или лекот што се испитува.
  • Регулаторна варијација и eQTL
  • Ретки типови гласини - WGS е правилен метод за истражување на ретки тумори. Техниката помага во проучување и снимање на целиот спектар на мутации, од единечни промени на базата (една база во Деоксирибонуклеинската киселина се разликува од вообичаената база во таа позиција) до поголеми хромозомски преуредувања, во еднократен експеримент.
  • Геномика на кланот - Педигре на семејни болести - прислушува мултиплексни педигре од семејства погодени од генетски проблеми.
  • Големи групи со екстензивно фенотипизирање

Редоследување на пушка

  • Ја истражува секвенцата на Деоксирибонуклеинска киселина во геномот на организмот.
  • Ефикасен метод за индиректна секвенца на рибонуклеинска киселина или протеини (преку нивните отворени рамки за читање)
  • Најпосакуваниот метод за сите други видови хаплоиден сет на хромозоми во секвенционирање на микроорганизми, исто така. По оваа техника е измерен севкупниот хаплоиден сет на хромозоми на многу организми - крава, пилешко, стаорци, растенија Arabidopsis thaliana, рибизја и многу микроскопски организми.
  • Речиси завршени и речиси конечни de novo собранија на микробни геноми за многу помалку денови
  • Моќта за секвенционирање на големи, комплексни геноми
  • Должина на читање на системот GS FLX+ до 1 kb
  • Изведете хибридни склопови

Чекори

Секвенционирање на целиот геном

  • Генерирање секвенционирање се чита директно од цел -геном (хаплоиден сет на хромозоми во микроорганизам) складиште
  • Примена на пресметковни методи за повторно составување во еден чекор
  • Се користи за овошна мува (Drosophila Melanogaster) и од Celera Genomics (развиена 1998 година) за човечки геном (хаплоиден сет на хромозоми во микроорганизам)

Редоследување на пушка

  • Чекорите во секвенционирањето на пушката вклучуваат;
  • Подготовка на библиотека
  • Редоследување на фрагментите на cfDNA
  • Броење фрагменти
  • Усогласување на секвенца
  • Статистичка анализа и известување.

Резиме

Точките на разлика помеѓу секвенционирање на целиот геном и секвенционирање на пушка се сумирани како подолу:

Секвенционирање на цел геном наспроти секвенционирање на пушка

Видете повеќе за: